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如果苹果手机上的短信被删除了，可以尝试以下几种方法来恢复。
1、使用iCloud备份恢复：如果开启了iCloud备份，可以进入设置 -> 通用 -> 还原，选择从iCloud备份恢复，在恢复过程中，系统会提示选择最近的备份，确认后等待恢复完成即可，需要注意的是，此方法会恢复所有备份过的数据，包括短信。
2、使用iTunes备份恢复：如果使用iTunes对手机进行过备份，可以使用此方法恢复短信，将iPhone连接到电脑上，启动iTunes并选择“恢复备份”，选择相应的备份文件并等待恢复完成，同样地，此方法也会恢复所有备份过的数据。
3、使用第三方软件恢复：如果没有开启iCloud或iTunes备份，可以尝试使用第三方软件来恢复删除的短信，可以使用易我iOS恢复大师等软件来扫描设备并尝试恢复删除的短信，但需要注意的是，使用第三方软件可能存在风险，因此需要谨慎操作。
4、直接向运营商查询：如果以上方法都无法恢复删除的短信，可以向手机运营商查询是否有可能找回，一些运营商可能会保留一段时间内的短信记录，可以尝试联系运营商查询并找回。
需要注意的是，在尝试以上方法之前，应该先停止使用设备以避免数据被进一步覆盖或损坏，数据恢复软件的效果可能因个人使用情况而异，无法保证一定能成功恢复所有删除的短信，建议定期备份重要数据以防万一。